上海交通大學體育教育的歷史可上溯至1896年南洋公學時期。在120多年的辦學歷程中，學校始終高度重視體育教育，逐步形成了“強國強身、崇尚文化、注重體育、健康向上”的思想。體育系成立于1985年，經過多年建設目前已形成一所（體育科學研究所）、一基地（國家體育總局體育文化研究基地）、三中心（上海交通大學學生體質健康監測中心、上海交通大學國際乒乓球交流中心、運動健康促進中心）、四教研室（籃手教研室、足排教研室、小球教研室和拳操教研室）。體育系擁有體育學一級學科碩士點、體育碩士專業學位點，2016 年與美國明尼蘇達大學聯合培養雙學位碩士，辦學實力穩步提升，連續 5 年在“中國最好學科排名”軟科排名中位列體育學學科前4，進入前全國 4%的學科。

近年來，交大體育深入貫徹習近平總書記“樹立健康第一的教育理念”，以“享受樂趣、增強體質、健全人格、錘煉意志”為目標，聚焦體育教育增值，形成了“課內與課外互動、校內與校外結合”的一體化教學模式和“以課程為核心，群體為基礎，競技為亮點，科研為動力”的發展體系。

堅持以“學會、勤練、常賽”為引領，積極推進體育教育教學改革。采用2個“1+X”課程模式，實施分層分級教學，不斷完善體育課程教學質量體系。實施體質健康提升工程，開設體質健康強化班，通過游泳達標作為畢業審核條件，將《學生體質健康標準》測試等級寫入成績大表等舉措，推動學生自覺參加體育鍛煉。建立體質監測體系平臺，規范和改進學生體質健康水平測試，同時通過不斷改善體質監測手段，建立電子化的體質監測體系，實行本科四年全覆蓋、全程監測，積極籌建構建學生體質健康管理平臺，無縫保障學生體質健康水平穩步提升。

作為教育部首批試辦高水平運動隊的高校之一，學校目前有游泳、籃球、乒乓球、賽艇、網球、田徑、羽毛球、足球等項目8支高水平體育代表隊。在2021年7月落幕的第十四屆全國學生運動會上，交大學生代表上海市參賽，經過頑強拼搏，共為上海代表團獲得35金13銀8銅，以金牌數第一、獎牌數第一、總分第一的傲人戰績在全國高校中遙遙領先，穩居第一，連續第八次蟬聯全國學生運動會“校長杯”。在2021年8月結束的東京奧運會上，共有23名交大人（在校學生和校友）分別作為運動員、領隊和教練為國出征，共獲得6金3銀2銅，展示了精湛的競技水平和昂揚的精神面貌。在2021年9月舉行的第十四屆全國運動會上，36名交大學子分別代表各自省市參賽，共斬獲18枚金牌、12枚銀牌、12枚銅牌，99人次進入籃球、賽艇、乒乓、游泳、體操、田徑、網球、羽毛球八個大項的前八名，讓“愛交大、愛運動”的精神和魅力點燃全運會賽場。

學校現有27支陽光體育代表隊和49個學生體育協會。加強對校學生體育總會的指導，完善指導教師選派制度，大力支持和指導體育社團建設，促進 校園群體活動蓬勃開展。以校運會、學生田徑運動會、新生運動會、五大杯賽（體總杯、校慶杯、致遠杯、新生杯、希望杯），兩次長跑（五一長跑節、12.9長跑節），水上運動會、智力運動會、舞林/武術大會等校園體育品牌賽事為紐帶，構建“天天有活動、周周有比賽、月月有精彩”的校園體育活動格局，每年校內舉辦90余項近2000場各類體育賽事，吸引參與師生超過 10 萬人次。27支校陽光體育代表隊選拔來自不同院系的500余名本碩博學生，堅持“品學訓”兼優，不斷完善日常教練機制，定期組織課余時間開展訓練，每年參與上海市和全國性陽光組體育比賽，戰績斐然；同時主動聘請學校相關部處長、知名教授擔任領隊，堅持協同育人，積極探索“三全育人”。

體育系目前擁有一支由國家級教學名師、教育部青年長江學者、國家社科基金項目評審專家、教育部新世紀優秀人才、教育部全國高等學校體育教學指導委員會委員、浦江學者組成的實力強、結構合理、國際化程度高的師資隊伍。其中，教授 5 名，博士 13 名，世界冠軍 4 名，國際級裁判 7 名、國家級裁判 8 名。近年來，獲國家級教學成果獎二等獎2項，上海市教學成果特等獎1項、一等獎1項、二等獎1項，上海交通大學教學成果特等獎1項；國家優秀教材二等獎1項；建成國家級教學團隊1個；國家線上一流課程2門，中國高校在線教學國際平臺課程1門，國家級精品課程1門，《Improving Immunity Based on Traditional Eastern Exercises》等2門課程與耶魯大學、密歇根大學等優質課程一起在世界上最大的在線教育平臺Coursera上線運行，上海高校優質混合式在線課程示范案例1項、上海市精品課程2門。

體育系堅持“高水平、國際化、小而精、服務型”的學科建設思路，積極培養服務國家、具有國際視野的高層次體育人才，推動體育學科若干領域前沿研究，努力建設成為國內一流、國際知名、特色鮮明的一流體育學科。國內第一家在體育學科領域與國外著名高校聯合培養雙學位，支持研究生海外訪學及參加頂尖學術會議等方式，77.5%以上碩士生學術有國外學習和交流經歷，進一步擴大了研究生國際視野和國際學術交流能力。近五年來先后主持包括國家社科基金、國家自 然基金項目等 10 項國家級研究項目（國家社科基金重點項目 2 項）、教育部及國家體育總局研究項目等 40 多項省部級項目，教材、著作 14 余部，發表 CSSCI、SCI、CIE、CSCD 高質量的論文期刊論文 70 余篇。研究成果連續被《決策建言》等采納或被省部級領導批示。